Edmon Colomer a fondé en 1983 le Joven Orquesta Nacional de España, qu'ildirige jusqu'en 1996, avant d'être le principal chef invité du Eastern Music Festival aux États-Unis en 1997 et 1998.
Il a été directeur musical de l'Orchestre de Picardie de 1998 à fin 2002. Il est, depuis, directeur musical de l'Orchestre symphonique des Baléares « Ciutat de Palma » et de l'Orchestre symphonique del Vallès à Barcelone. Outre les plus grands orchestres espagnols qu'il dirige très régulièrement, il est invité par de nombreux orchestres internationaux.
Les événements marquants de sa carrière incluent, entre autres, les productions scéniques de Macbeth (1985), Wozzeck (1987) et Don Giovanni (1994) à Madrid, les représentations de Atlàntida de Falla lors d'une tournée espagnole, les productions de Picasso et la Danse (1992) et de Casse-Noisette / Béjart (1999) à Paris, ainsi que ses débuts aux Proms en 1996 avec La Peste de Gerhard et la tournée en France d'une production d'Ariadne auf Naxos (2000-2001). Edmon Colomer est Chevalier de l'ordre des Palmes académiques.